Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dok4Q99KE3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dok4Q99KE3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dok4Q99KE3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dok4Q99KE3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dok4Q99KE3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms