Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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