Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf144aQ925F3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms