Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NifkQ91VE6 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms