Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubxn4Q8VCH8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms