Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fndc5Q8K4Z2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc5Q8K4Z2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms