Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3F2

Mmp21, Matrix metalloproteinase-21, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp21Q8K3F2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp21Q8K3F2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp21Q8K3F2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Mmp21Q8K3F2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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