Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ssh3Q8K330 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ssh3Q8K330 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms