Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms