Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CntrobQ8CB62 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms