Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssuh2Q8C3L1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms