Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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