Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms