Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cdca8Q8BHX3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cdca8Q8BHX3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdca8Q8BHX3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdca8Q8BHX3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms