Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AknaQ80VW7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms