Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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NischQ80TM9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
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NischQ80TM9 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NischQ80TM9 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
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