Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Clec18aQ7TSQ1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms