Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih3Q6ZWS4 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms