Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms