Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc154Q6RUT8 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc154Q6RUT8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms