Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms