Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Cst6-201ENSMUST00000025764 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptbn2Q68FG2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms