Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Ccdc18Q640L5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc18Q640L5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc18Q640L5 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms