Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sema3cQ62181 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms