Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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AtrxQ61687 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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AtrxQ61687 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
AtrxQ61687 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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AtrxQ61687 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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AtrxQ61687 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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AtrxQ61687 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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AtrxQ61687 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
AtrxQ61687 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms