Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tdrd5Q5VCS6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tdrd5Q5VCS6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms