Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fam208bQ5DTT3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Fam208bQ5DTT3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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Fam208bQ5DTT3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Fam208bQ5DTT3 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Fam208bQ5DTT3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Fam208bQ5DTT3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Fam208bQ5DTT3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms