Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znf608Q56A10 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms