Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc43Q3V0L5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrrc43Q3V0L5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc43Q3V0L5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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