Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skap2Q3UND0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms