Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Usp30Q3UN04 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Usp30Q3UN04 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp30Q3UN04 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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