Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Arfgef3Q3UGY8 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Arfgef3Q3UGY8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Arfgef3Q3UGY8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Arfgef3Q3UGY8 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Arfgef3Q3UGY8 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Arfgef3Q3UGY8 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Arfgef3Q3UGY8 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arfgef3Q3UGY8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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