Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms