Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shcbp1lQ3TTP0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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