Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gtf3c3Q3TMP1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms