Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hddc2Q3SXD3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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