Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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