Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Traf3ip1Q149C2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms