Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps8Q0P5W1 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms