Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sox8Q04886 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms