Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rbp4Q00724 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms