Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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AlkP97793 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AlkP97793 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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AlkP97793 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AlkP97793 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AlkP97793 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AlkP97793 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AlkP97793 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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AlkP97793 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AlkP97793 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms