Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps3aP97351 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps3aP97351 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms