Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cbx1P83917 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms