Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gbx1P82976 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gbx1P82976 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms