Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Irx1P81068 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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