Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ufm1P61961 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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