Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Csrnp3P59055 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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