Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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CtdsplP58465 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CtdsplP58465 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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CtdsplP58465 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CtdsplP58465 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms