Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cldn18P56857 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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